С 1986 года Марко Япель работает внештатным художником по свету, сейчас на его счету более двухсот спектаклей в Словении и других странах. Он изучал архитектуру в Любляне, его первой театральной работой стало оформление спектакля «Гедда Габлер» по одноимённой пьесе Генрика Ибсена в Академии театра, радио, кино и телевидения в Любляне. Впервые в качестве сценографа М. Япель в профессиональном театре поставил песу «Три сестры» А.П. Чехова в Словенском Национальном театре (Марибор, 1987).
Создавал сценический дизайн для драмы, оперы и современных танцевальных постановок в Национальном Театре Словении, Национальном театре в Загребе, Хорватском Национальном театре в Риеке, Национальных театрах Белграда и Подгорицы, Национальном театре Румынии в Бухаресте, Цюрихском оперном театре, Музыкальном театре Эссена, Городском театре Аугсбурга, Королевском балете Фландрии, Нидерландском театре танца, Венской Государственной опере, Дортмундском театре, Латвийской Национальной опере, Балете Западной Австралии и т. д.
С хореографом Эдвардом Клюгом работал над постановками: Tango (1998), Lacrimas, Radio&Juliet, Architecture of Silence, Pret a Porter, Watching others, Hill Harper’s Hill, Chamber minds, Sacre du printemps, Peer Gynt, Hora, Proof и другими.
За свою работу Марко Япель получил множество наград. С 1995 по 1997 годы читал лекции в качестве приглашенного профессора и был заведующим кафедрой театра и сценографии в Венском университете прикладных искусств.